Os métodos de aquisição e critérios de seleção das coleções documentais, foram determinados pelo Sr. Tiago Estrela, filatelista e numismático, já falecido e pela Dr.ª Núria Santos, museóloga natural de Panamá, então dinamizadores do museu.
Além do recurso aos catálogos de colecionadores portugueses, foi lançada uma campanha em jornais nacionais, durante o mês de setembro de 1991, para incentivar o público a disponibilizar ao Arquivo as peças que dispunham, tendo surgido contactos das ilhas e do exterior. Assim, se fez a aquisição de várias peças ao longo dos anos.
Atualmente o MDE possui as seguintes modalidades de aquisição de peças:
Doação, compra e depósitos (do BCV e dos Correios de Cabo Verde).